Σύμφωνα με ελέγχους που πραγματοποίησαν ερευνητές στο πεδίο της διαδικτυακής ασφάλειας προέκυψε πως υπάρχει ένας κρυφός φάκελος στις συσκευές iPhone και iPad 3G, ο οποίος περιέχει ένα αρχείο με λεπτομέρειες όλων των γεωγραφικών τοποθεσιών όπου έχουν βρεθεί οι χρήστες του. Κάποιοι εξ αυτών μάλιστα κατάφεραν να εξάγουν τα δεδομένα του αρχείου, συντεταγμένες γεωγραφικού πλάτους και μήκους, και να τα δημοσιοποιήσουν με την μορφή χαρτών.Από την πλευρά της η Apple, τόνισε πως η συσκευή δεν καταγράφει κάθε στιγμή τις κινήσεις του χρήστη, αλλά εντοπίζει τις πιο κοντινές υποδομές κινητής τηλεφωνίας και ασύρματων δικτύων. Στη συνέχεια αυτά τα στοιχεία στέλνονται σε αυτήν με ανώνυμο και κρυπτογραφημένο τρόπο, με συνέπεια η ίδια, όπως τονίζει, να μην μπορεί να εντοπίσει εξατομικευμένα την πηγή αποστολής των δεδομένων. Η αξιοποίηση αυτών των δεδομένων σχετίζεται με την παροχή στοιχείων στις εταιρίες μάρκετινγκ και διαφήμισης για να προωθήσουν στους χρήστες τα κατάλληλα διαφημιστικά μηνύματα, ανάλογα με τη γεωγραφική θέση του. Η Apple αναγνώρισε ότι αποτελεί πρόβλημα το γεγονός πως τα συλλεγόμενα με αυτόν τον τρόπο στοιχεία πηγαίνουν πολλούς μήνες πίσω στο παρελθόν όταν αποθηκεύονται και αναμένεται να το διορθώσει άμεσα. Σε λίγες εβδομάδες θα υπάρξει μια δωρεάν ενημέρωση του λογισμικού iOS, η οποία θα κρυπτογραφήσει το αρχείο αποθήκευσης αυτών των στοιχείων. Επίσης, θα μειωθεί από ένα χρόνο σε επτά μέρες το πολύ η χρονική διάρκεια αποθήκευσης αυτών των δεδομένων, ενώ θα σταματήσει να γίνεται "back-up" των στοιχείων στο iTunes. Ωστόσο έχει δημιουργηθεί έστω και προσωρινά κίνδυνος από άποψη ασφάλειας για τους κατόχους iPhone, καθώς οι χάκερ ξέρουν πλέον ότι υπάρχει ένας ευάλωτος φάκελος με μη κρυπτογραφημένα δεδομένα εντοπισμού γεωγραφικής θέσης.